地下城堡2中副本的开启方式多种多样，核心通常涉及特定道具的获取与制作、完成前置任务或达到一定的属性要求，而非单纯的等级限制。部分副本的开启还与探索特定地图据点密切相关，玩家需要按照游戏内的逻辑线索逐步解锁。
最典型的一种开启方式是获取并制作专属的进入道具。想要进入周末副本，玩家首先需要在市场的宝物界面中，花费5000金币购买龙纹银币。携带这枚银币前往图9季风平原正右方（坐标约13,的据点龙喉堡进行探索，通过后即可获得仿制龙纹硬币的蓝图。拿到蓝图后，前往工坊消耗铁、秘银和强者血液等材料进行制作，最后前往副本入口（坐标45,22）即可消耗一枚仿制龙纹硬币进入。如果当日挑战失败，可以再消耗300食物获得一次额外的挑战机会，之后每日挑战则直接使用工坊制作的硬币即可。另一种常见的道具开启案例是远山庄园副本，玩家首次进入需要先在图9王城左上角击败名为伪装者的怪物，从而获得第一把庄园钥匙。使用这把钥匙即可开启位于图8湿地左上角的远山庄园副本。首次通关普通难度后，会获得庄园钥匙的蓝图，之后便可自行在工坊制作钥匙（需要铁、秘银和强者血液）来反复进入挑战难度。
除了直接使用道具，许多副本的解锁与游戏主线进程深度绑定，需要完成一系列前置条件。想要开启图16的相关副本区域，玩家必须完全打通图15的所有主线任务，并在图15的最终BOSS战中获取一个关键的开启卷轴道具。之后在图16中，还需要挑战分布在不同位置的五个属性试炼据点，分别要求队伍中指定角色达到950力量、900速度、950技巧、950魔力等极高的属性阈值，全部完成后才能驱散迷雾，解锁隐藏的最终BOSS区域。裁判所副本的开启也遵循类似逻辑，玩家需要先前往图3失落王城右上角（坐标42,的白门旁边，调查一个头骨状的物体来获取裁判所徽记的蓝图，首次开门时还要求队伍中有角色的力量属性达到450点。拿到蓝图后，同样需要在工坊消耗大量资源制作出徽记，才能作为进入凭证。
一些特殊副本或玩法的开启，则依赖于完成特定的支线任务链或达到特殊的探索进度。想要进入幽谷副本，玩家必须携带驱魔粉才能开启位于图7幻境森林（坐标17,的入口。而驱魔粉的获取途径是探索图12冰峰谷的炼金工坊据点，当该据点的探索进度达到50%时，会直接掉落成品驱魔粉；当进度达到100%后，才能获得驱魔粉的制作蓝图，之后便可自行量产。游戏中期重要的裂隙玩法以及遗迹副本，通常是在推进主线至图14遗忘之地并修复位于（51,51）坐标的炼金阵后逐步解锁。而贯穿游戏全程的影兽系列任务，其每一阶段的挑战副本会在玩家到达特定地图（如图12冰峰谷、图14遗忘之地、图17世界边缘等）时自动触发，无需额外寻找入口，但挑战地点就在各张地图的初始传送点附近。
