初始阶段需要做好充分准备，选择适合自己战斗风格的初始宝可梦至关重要。妙蛙种子擅长防御和恢复，杰尼龟以耐久和水系技能见长，小火龙则是攻击型选手，速度和攻击力都很出色。游戏开始时主角从家中出发，与大木博士相遇后选择初始宝可梦并与劲敌小茂进行首次对战。无论选择哪只宝可梦，小茂都会选择属性克制的宝可梦应战。在常磐市的商店取得大木博士的包裹后返回真新镇，可获得宝可梦图鉴和精灵球，正式开启冒险旅程。
前期需要穿过常磐森林前往尼比市挑战第一个道馆。常磐森林中可捕捉皮卡丘和绿毛虫，绿毛虫进化成巴大蝴后可学习催眠粉和麻痹粉，是后期捕捉神兽的利器。尼比市道馆馆主小刚使用岩石系宝可梦，建议将小火龙的血量保持在健康状态应对大岩蛇。击败小刚后获得灰色徽章，接着前往月见山，途中会遇到大木博士的助手并获得跑步鞋。月见山是重要剧情地点，首次遭遇火箭队并获取化石，需要在两个化石中选择一个，左边是化石盔右边是菊石兽。
中期需要依次挑战华蓝市和枯叶市的道馆。华蓝市道馆馆主小霞使用水系宝可梦，如果初始选择小火龙建议进化成喷火龙后再来挑战。在华蓝市右上方的25号路可遇到正辉，帮助他恢复原形后获得船票。枯叶市道馆需要先获得一字斩技能砍断门口小树，道馆内部机关需在垃圾桶中找到两个开关才能挑战馆主马志士。圣安奴号是重要剧情场景，船上可获取多种道具并与训练师对战，在船长室获得一字斩技能机。电系道馆胜利后获得橙色徽章，可通过地鼠洞返回尼比市。
后期需要解决紫苑镇宝可梦塔的幽灵事件并挑战剩余道馆。在彩虹市游戏厅击败火箭队成员，通过隐藏通道进入火箭队基地，击败坂木老大后获得观测镜才能看清宝可梦塔中的幽灵。唤醒挡路的卡比兽需要使用宝可梦笛子，该道具在解救富士老人后获得。浅红市道馆是毒系，金黄市道馆是超能力系，红莲岛道馆是火系，每个道馆都有独特的机关设计。集齐八个徽章后即可前往石英高原挑战四天王和冠军，队伍中建议包含多种属性宝可梦以应对不同类型的对手，等级保持在55级以上较为稳妥。
通关过程中需注意合理分配资源，及时使用道具恢复宝可梦状态。野生宝可梦的捕捉和训练师对战是提升等级的主要途径，道馆战前建议将主力宝可梦等级提升至高于馆主最高等级宝可梦3-5级。重要技能机如冲浪、怪力等需要分配给合适的宝可梦学习以通过地形障碍。与NPC的对话可能提供关键线索或隐藏道具，探索时需仔细检查每个角落。一周目通关后读取存档可进入二周目内容，开启更多探索区域和剧情任务。
